Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
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RABGGTBP53611 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RABGGTBP53611 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABGGTBP53611 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RABGGTBP53611 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.57■■■□□ 2
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RABGGTBP53611 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABGGTBP53611 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABGGTBP53611 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABGGTBP53611 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
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RABGGTBP53611 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABGGTBP53611 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RABGGTBP53611 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
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RABGGTBP53611 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RABGGTBP53611 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
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RABGGTBP53611 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
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RABGGTBP53611 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGGTBP53611 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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RABGGTBP53611 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
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