Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
SMARCA4P51532 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
SMARCA4P51532 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
SMARCA4P51532 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
SMARCA4P51532 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
SMARCA4P51532 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
SMARCA4P51532 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
SMARCA4P51532 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
SMARCA4P51532 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
SMARCA4P51532 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
SMARCA4P51532 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
SMARCA4P51532 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
SMARCA4P51532 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
SMARCA4P51532 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
SMARCA4P51532 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC46.27■■■■■ 5
SMARCA4P51532 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
SMARCA4P51532 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC46.27■■■■■ 5
SMARCA4P51532 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC46.26■■■■■ 5
SMARCA4P51532 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
SMARCA4P51532 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
SMARCA4P51532 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
SMARCA4P51532 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
SMARCA4P51532 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC46.25■■■■■ 4.99
SMARCA4P51532 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC46.25■■■■■ 4.99
SMARCA4P51532 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
SMARCA4P51532 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC46.22■■■■■ 4.99
SMARCA4P51532 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
SMARCA4P51532 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
SMARCA4P51532 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC46.21■■■■■ 4.99
SMARCA4P51532 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
SMARCA4P51532 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
SMARCA4P51532 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
SMARCA4P51532 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
SMARCA4P51532 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC46.16■■■■■ 4.98
SMARCA4P51532 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
SMARCA4P51532 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
SMARCA4P51532 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
SMARCA4P51532 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
SMARCA4P51532 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC46.15■■■■■ 4.98
SMARCA4P51532 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
SMARCA4P51532 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
SMARCA4P51532 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC46.15■■■■■ 4.98
SMARCA4P51532 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
SMARCA4P51532 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC46.14■■■■■ 4.98
SMARCA4P51532 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
SMARCA4P51532 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
SMARCA4P51532 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC46.11■■■■■ 4.97
SMARCA4P51532 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
SMARCA4P51532 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
SMARCA4P51532 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
SMARCA4P51532 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.1■■■■■ 4.97
SMARCA4P51532 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
SMARCA4P51532 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
SMARCA4P51532 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
SMARCA4P51532 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC46.08■■■■■ 4.97
SMARCA4P51532 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
SMARCA4P51532 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
SMARCA4P51532 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
SMARCA4P51532 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
SMARCA4P51532 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC46.04■■■■■ 4.96
SMARCA4P51532 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
SMARCA4P51532 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC46.04■■■■■ 4.96
SMARCA4P51532 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
SMARCA4P51532 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
SMARCA4P51532 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
SMARCA4P51532 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
SMARCA4P51532 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
SMARCA4P51532 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC46.01■■■■■ 4.96
SMARCA4P51532 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC45.99■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC45.99■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC45.97■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC45.96■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.94■■■■■ 4.95
SMARCA4P51532 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
SMARCA4P51532 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
SMARCA4P51532 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
SMARCA4P51532 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
SMARCA4P51532 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC45.9■■■■■ 4.94
SMARCA4P51532 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
SMARCA4P51532 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
SMARCA4P51532 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.9■■■■■ 4.94
SMARCA4P51532 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC45.9■■■■■ 4.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms