Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCP4P48539 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCP4P48539 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCP4P48539 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCP4P48539 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCP4P48539 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCP4P48539 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCP4P48539 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCP4P48539 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCP4P48539 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCP4P48539 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PCP4P48539 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCP4P48539 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCP4P48539 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCP4P48539 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCP4P48539 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCP4P48539 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCP4P48539 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCP4P48539 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCP4P48539 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCP4P48539 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCP4P48539 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCP4P48539 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCP4P48539 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCP4P48539 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCP4P48539 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCP4P48539 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCP4P48539 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCP4P48539 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCP4P48539 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCP4P48539 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCP4P48539 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCP4P48539 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCP4P48539 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCP4P48539 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCP4P48539 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCP4P48539 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCP4P48539 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCP4P48539 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCP4P48539 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCP4P48539 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCP4P48539 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCP4P48539 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCP4P48539 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCP4P48539 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCP4P48539 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCP4P48539 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCP4P48539 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCP4P48539 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCP4P48539 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCP4P48539 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCP4P48539 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCP4P48539 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PCP4P48539 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PCP4P48539 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCP4P48539 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCP4P48539 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCP4P48539 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCP4P48539 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCP4P48539 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCP4P48539 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCP4P48539 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCP4P48539 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PCP4P48539 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCP4P48539 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCP4P48539 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCP4P48539 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCP4P48539 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCP4P48539 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCP4P48539 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCP4P48539 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCP4P48539 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCP4P48539 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCP4P48539 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCP4P48539 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCP4P48539 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCP4P48539 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCP4P48539 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCP4P48539 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCP4P48539 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCP4P48539 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCP4P48539 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCP4P48539 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCP4P48539 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCP4P48539 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCP4P48539 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCP4P48539 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCP4P48539 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCP4P48539 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCP4P48539 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCP4P48539 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCP4P48539 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCP4P48539 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCP4P48539 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCP4P48539 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCP4P48539 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCP4P48539 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCP4P48539 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCP4P48539 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCP4P48539 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms