Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGFRP43088 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGFRP43088 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTGFRP43088 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGFRP43088 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms