Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRS3P32247 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRS3P32247 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRS3P32247 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRS3P32247 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRS3P32247 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRS3P32247 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRS3P32247 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRS3P32247 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRS3P32247 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRS3P32247 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRS3P32247 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRS3P32247 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRS3P32247 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRS3P32247 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRS3P32247 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRS3P32247 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRS3P32247 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BRS3P32247 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRS3P32247 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRS3P32247 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRS3P32247 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRS3P32247 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRS3P32247 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BRS3P32247 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRS3P32247 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRS3P32247 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRS3P32247 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRS3P32247 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRS3P32247 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRS3P32247 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRS3P32247 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRS3P32247 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRS3P32247 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRS3P32247 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRS3P32247 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BRS3P32247 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRS3P32247 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRS3P32247 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BRS3P32247 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRS3P32247 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRS3P32247 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRS3P32247 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRS3P32247 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRS3P32247 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRS3P32247 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRS3P32247 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRS3P32247 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRS3P32247 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRS3P32247 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRS3P32247 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRS3P32247 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRS3P32247 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRS3P32247 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRS3P32247 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRS3P32247 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRS3P32247 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRS3P32247 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRS3P32247 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRS3P32247 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BRS3P32247 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRS3P32247 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRS3P32247 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRS3P32247 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BRS3P32247 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRS3P32247 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRS3P32247 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRS3P32247 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRS3P32247 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRS3P32247 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BRS3P32247 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRS3P32247 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRS3P32247 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRS3P32247 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BRS3P32247 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRS3P32247 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRS3P32247 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRS3P32247 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRS3P32247 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRS3P32247 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BRS3P32247 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRS3P32247 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRS3P32247 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BRS3P32247 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BRS3P32247 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRS3P32247 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRS3P32247 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BRS3P32247 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRS3P32247 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRS3P32247 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRS3P32247 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRS3P32247 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRS3P32247 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRS3P32247 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRS3P32247 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRS3P32247 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRS3P32247 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRS3P32247 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRS3P32247 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRS3P32247 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms