Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HOXC8P31273 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC8P31273 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC8P31273 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
HOXC8P31273 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXC8P31273 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXC8P31273 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXC8P31273 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms