Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARID4AP29374 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARID4AP29374 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID4AP29374 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID4AP29374 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID4AP29374 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID4AP29374 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARID4AP29374 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ARID4AP29374 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ARID4AP29374 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ARID4AP29374 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARID4AP29374 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID4AP29374 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms