Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
LAMA1P25391 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMA1P25391 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA1P25391 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 931 ms