Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP4AP20648 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP4AP20648 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATP4AP20648 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms