Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGB5P18084 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGB5P18084 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB5P18084 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGB5P18084 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB5P18084 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms