Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFTPCP11686 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFTPCP11686 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFTPCP11686 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms