Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RGPD2P0DJD1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD2P0DJD1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
RGPD2P0DJD1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
RGPD2P0DJD1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGPD2P0DJD1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms