Protein–RNA interactions for Protein: P08425

MSF1, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSF1P08425 MTC6YHR151C 1581 nt7.36□□□□□ -1.23
MSF1P08425 SPS1YDR523C 1473 nt7.36□□□□□ -1.23
MSF1P08425 ADE16YLR028C 1776 nt7.36□□□□□ -1.23
MSF1P08425 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.35□□□□□ -1.23
MSF1P08425 TRR2YHR106W 1029 nt7.35□□□□□ -1.23
MSF1P08425 PRY2YKR013W 990 nt7.35□□□□□ -1.23
MSF1P08425 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.35□□□□□ -1.23
MSF1P08425 SPE3YPR069C 882 nt7.35□□□□□ -1.23
MSF1P08425 PMT7YDR307W 1989 nt7.33□□□□□ -1.24
MSF1P08425 PIL1YGR086C 1020 nt7.33□□□□□ -1.24
MSF1P08425 YER152CYER152C 1332 nt7.32□□□□□ -1.24
MSF1P08425 YPT10YBR264C 600 nt7.32□□□□□ -1.24
MSF1P08425 PLB3YOL011W 2061 nt7.32□□□□□ -1.24
MSF1P08425 CDA1YLR307W 906 nt7.31□□□□□ -1.24
MSF1P08425 DSC3YOR223W 879 nt7.31□□□□□ -1.24
MSF1P08425 PDC5YLR134W 1692 nt7.31□□□□□ -1.24
MSF1P08425 YJL045WYJL045W 1905 nt7.31□□□□□ -1.24
MSF1P08425 PPZ2YDR436W 2133 nt7.3□□□□□ -1.24
MSF1P08425 STF1YDL130W-A 261 nt7.3□□□□□ -1.24
MSF1P08425 ECM10YEL030W 1935 nt7.3□□□□□ -1.24
MSF1P08425 ALR1YOL130W 2580 nt7.3□□□□□ -1.24
MSF1P08425 FIT1YDR534C 1587 nt7.29□□□□□ -1.24
MSF1P08425 MDH2YOL126C 1134 nt7.29□□□□□ -1.24
MSF1P08425 AOS1YPR180W 1044 nt7.29□□□□□ -1.24
MSF1P08425 MPH3YJR160C 1809 nt7.29□□□□□ -1.24
MSF1P08425 GET2YER083C 858 nt7.28□□□□□ -1.24
MSF1P08425 YML122CYML122C 381 nt7.28□□□□□ -1.24
MSF1P08425 SKP1YDR328C 585 nt7.27□□□□□ -1.25
MSF1P08425 POR2YIL114C 846 nt7.27□□□□□ -1.25
MSF1P08425 PEX28YHR150W 1740 nt7.27□□□□□ -1.25
MSF1P08425 AVL9YLR114C 2295 nt7.26□□□□□ -1.25
MSF1P08425 PFS2YNL317W 1398 nt7.26□□□□□ -1.25
MSF1P08425 YHR033WYHR033W 1272 nt7.26□□□□□ -1.25
MSF1P08425 HAM1YJR069C 594 nt7.26□□□□□ -1.25
MSF1P08425 SML1YML058W 315 nt7.26□□□□□ -1.25
MSF1P08425 BIO3YNR058W 1443 nt7.26□□□□□ -1.25
MSF1P08425 DCR2YLR361C 1737 nt7.25□□□□□ -1.25
MSF1P08425 NAF1YNL124W 1479 nt7.24□□□□□ -1.25
MSF1P08425 SGF73YGL066W 1974 nt7.24□□□□□ -1.25
MSF1P08425 PDA1YER178W 1263 nt7.24□□□□□ -1.25
MSF1P08425 CKB1YGL019W 837 nt7.24□□□□□ -1.25
MSF1P08425 SPG1YGR236C 288 nt7.24□□□□□ -1.25
MSF1P08425 VPS65YLR322W 315 nt7.24□□□□□ -1.25
MSF1P08425 snR30snR30 606 nt7.24□□□□□ -1.25
MSF1P08425 HSV2YGR223C 1347 nt7.24□□□□□ -1.25
MSF1P08425 SNA3YJL151C 402 nt7.23□□□□□ -1.25
MSF1P08425 ERG10YPL028W 1197 nt7.23□□□□□ -1.25
MSF1P08425 ECM27YJR106W 2178 nt7.23□□□□□ -1.25
MSF1P08425 NFS1YCL017C 1494 nt7.23□□□□□ -1.25
MSF1P08425 DML1YMR211W 1428 nt7.22□□□□□ -1.25
MSF1P08425 YDR215CYDR215C 414 nt7.22□□□□□ -1.25
MSF1P08425 PAM17YKR065C 594 nt7.22□□□□□ -1.25
MSF1P08425 ERV25YML012W 636 nt7.22□□□□□ -1.25
MSF1P08425 RUP1YOR138C 2016 nt7.22□□□□□ -1.25
MSF1P08425 PMP3YDR276C 168 nt7.21□□□□□ -1.26
MSF1P08425 DAL80YKR034W 810 nt7.21□□□□□ -1.26
MSF1P08425 YHR131CYHR131C 2553 nt7.21□□□□□ -1.26
MSF1P08425 LDB7YBL006C 543 nt7.2□□□□□ -1.26
MSF1P08425 BDS1YOL164W 1941 nt7.2□□□□□ -1.26
MSF1P08425 YPQ2YDR352W 954 nt7.19□□□□□ -1.26
MSF1P08425 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.19□□□□□ -1.26
MSF1P08425 OPI1YHL020C 1215 nt7.19□□□□□ -1.26
MSF1P08425 YJL213WYJL213W 996 nt7.19□□□□□ -1.26
MSF1P08425 YLR162WYLR162W 357 nt7.19□□□□□ -1.26
MSF1P08425 YPC1YBR183W 951 nt7.19□□□□□ -1.26
MSF1P08425 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.18□□□□□ -1.26
MSF1P08425 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.18□□□□□ -1.26
MSF1P08425 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.18□□□□□ -1.26
MSF1P08425 YJR154WYJR154W 1041 nt7.18□□□□□ -1.26
MSF1P08425 GAL83YER027C 1254 nt7.17□□□□□ -1.26
MSF1P08425 UFD1YGR048W 1086 nt7.17□□□□□ -1.26
MSF1P08425 RCF2YNR018W 675 nt7.17□□□□□ -1.26
MSF1P08425 RSC9YML127W 1746 nt7.17□□□□□ -1.26
MSF1P08425 LPD1YFL018C 1500 nt7.17□□□□□ -1.26
MSF1P08425 CYS4YGR155W 1524 nt7.17□□□□□ -1.26
MSF1P08425 GUT1YHL032C 2130 nt7.16□□□□□ -1.26
MSF1P08425 CCW12YLR110C 402 nt7.16□□□□□ -1.26
MSF1P08425 DPM1YPR183W 804 nt7.16□□□□□ -1.26
MSF1P08425 YBL113CYBL113C 2379 nt7.15□□□□□ -1.27
MSF1P08425 FCY22YER060W-A 1593 nt7.14□□□□□ -1.27
MSF1P08425 PET10YKR046C 852 nt7.14□□□□□ -1.27
MSF1P08425 SUN4YNL066W 1263 nt7.14□□□□□ -1.27
MSF1P08425 LEO1YOR123C 1395 nt7.14□□□□□ -1.27
MSF1P08425 YPR130CYPR130C 408 nt7.14□□□□□ -1.27
MSF1P08425 YCL049CYCL049C 939 nt7.14□□□□□ -1.27
MSF1P08425 CIT2YCR005C 1383 nt7.13□□□□□ -1.27
MSF1P08425 TUB1YML085C 1344 nt7.13□□□□□ -1.27
MSF1P08425 YOL046CYOL046C 675 nt7.13□□□□□ -1.27
MSF1P08425 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.12□□□□□ -1.27
MSF1P08425 RTC4YNL254C 1206 nt7.11□□□□□ -1.27
MSF1P08425 HNM1YGL077C 1692 nt7.11□□□□□ -1.27
MSF1P08425 CBK1YNL161W 2271 nt7.1□□□□□ -1.27
MSF1P08425 TCB1YOR086C 3561 nt7.1□□□□□ -1.27
MSF1P08425 CAR2YLR438W 1275 nt7.1□□□□□ -1.27
MSF1P08425 YMR074CYMR074C 438 nt7.1□□□□□ -1.27
MSF1P08425 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.1□□□□□ -1.27
MSF1P08425 YJL163CYJL163C 1668 nt7.09□□□□□ -1.27
MSF1P08425 SNF7YLR025W 723 nt7.09□□□□□ -1.27
MSF1P08425 GET4YOR164C 939 nt7.09□□□□□ -1.27
MSF1P08425 HXT9YJL219W 1704 nt7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms