Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK2AP2O75956 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK2AP2O75956 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK2AP2O75956 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms