Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SS18L1O75177 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SS18L1O75177 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SS18L1O75177 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms