Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SPTLC1O15269 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTLC1O15269 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTLC1O15269 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms