Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3CDO00329 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PIK3CDO00329 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3CDO00329 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3CDO00329 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms