Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPIPB8E9PQR5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPB8E9PQR5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPIPB8E9PQR5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPB8E9PQR5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPB8E9PQR5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPB8E9PQR5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPB8E9PQR5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPB8E9PQR5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPB8E9PQR5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPIPB8E9PQR5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPIPB8E9PQR5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPIPB8E9PQR5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPB8E9PQR5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPB8E9PQR5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPB8E9PQR5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPB8E9PQR5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPB8E9PQR5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms