Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Samd1D3YXK1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Samd1D3YXK1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samd1D3YXK1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Samd1D3YXK1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms