Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNRNPCL3B7ZW38 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HNRNPCL3B7ZW38 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HNRNPCL3B7ZW38 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HNRNPCL3B7ZW38 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HNRNPCL3B7ZW38 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms