Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ERVV-1B6SEH8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ERVV-1B6SEH8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
ERVV-1B6SEH8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ERVV-1B6SEH8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERVV-1B6SEH8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ERVV-1B6SEH8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ERVV-1B6SEH8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
ERVV-1B6SEH8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ERVV-1B6SEH8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ERVV-1B6SEH8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ERVV-1B6SEH8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ERVV-1B6SEH8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ERVV-1B6SEH8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
ERVV-1B6SEH8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ERVV-1B6SEH8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ERVV-1B6SEH8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ERVV-1B6SEH8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms