Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms