RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468254.5

CEP170-211, Transcript of centrosomal protein 170, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CEP170, Length 2,972 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170-211ENST00000468254 CHIC1Q5VXU3 224 aa8.64□□□□□ -1.03
CEP170-211ENST00000468254 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CEP170-211ENST00000468254 NISCHQ9Y2I1 1504 aa7.92□□□□□ -1.14
CEP170-211ENST00000468254 EHMT2Q96KQ7 1210 aa7.9□□□□□ -1.14
CEP170-211ENST00000468254 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CEP170-211ENST00000468254 SLC24A1O60721 1099 aa7.72□□□□□ -1.17
CEP170-211ENST00000468254 PLPPR3Q6T4P5 718 aa7.55□□□□□ -1.2
CEP170-211ENST00000468254 KCNA4P22459 653 aa7.41□□□□□ -1.22
CEP170-211ENST00000468254 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CEP170-211ENST00000468254 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.33□□□□□ -1.24
CEP170-211ENST00000468254 ADRA2BP18089 450 aa7.17□□□□□ -1.26
CEP170-211ENST00000468254 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.16□□□□□ -1.26
CEP170-211ENST00000468254 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CEP170-211ENST00000468254 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CEP170-211ENST00000468254 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CEP170-211ENST00000468254 ZBTB22O15209 634 aa6.9□□□□□ -1.3
CEP170-211ENST00000468254 PPP6R1Q9UPN7 881 aa6.84□□□□□ -1.32
CEP170-211ENST00000468254 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CEP170-211ENST00000468254 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa6.78□□□□□ -1.32
CEP170-211ENST00000468254 MYO15BQ96JP2 1530 aa6.75□□□□□ -1.33
CEP170-211ENST00000468254 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CEP170-211ENST00000468254 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CEP170-211ENST00000468254 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CEP170-211ENST00000468254 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.63□□□□□ -1.35
CEP170-211ENST00000468254 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CEP170-211ENST00000468254 TAOK2Q9UL54 1235 aa6.61□□□□□ -1.35
CEP170-211ENST00000468254 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.6□□□□□ -1.35
CEP170-211ENST00000468254 FKBP8Q14318 412 aa6.58□□□□□ -1.36
CEP170-211ENST00000468254 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.57□□□□□ -1.36
CEP170-211ENST00000468254 NACADO15069 1562 aa6.55□□□□□ -1.36
CEP170-211ENST00000468254 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CEP170-211ENST00000468254 POTEDQ86YR6 584 aa6.55□□□□□ -1.36
CEP170-211ENST00000468254 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CEP170-211ENST00000468254 PLCB2Q00722 1185 aa6.52□□□□□ -1.37
CEP170-211ENST00000468254 BCANQ96GW7 911 aa6.47□□□□□ -1.37
CEP170-211ENST00000468254 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa6.44□□□□□ -1.38
CEP170-211ENST00000468254 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.42□□□□□ -1.38
CEP170-211ENST00000468254 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.41□□□□□ -1.38
CEP170-211ENST00000468254 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.39□□□□□ -1.39
CEP170-211ENST00000468254 FOXD1Q16676 465 aa6.38□□□□□ -1.39
CEP170-211ENST00000468254 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.38□□□□□ -1.39
CEP170-211ENST00000468254 FBLN2P98095 1184 aa6.38□□□□□ -1.39
CEP170-211ENST00000468254 DCAF8L2P0C7V8 631 aa6.37□□□□□ -1.39
CEP170-211ENST00000468254 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.36□□□□□ -1.39
CEP170-211ENST00000468254 ARXQ96QS3 562 aa6.33□□□□□ -1.4
CEP170-211ENST00000468254 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.29□□□□□ -1.4
CEP170-211ENST00000468254 ABCC9O60706 1549 aa6.29□□□□□ -1.4
CEP170-211ENST00000468254 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.24□□□□□ -1.41
CEP170-211ENST00000468254 HOMEZQ8IX15 550 aa6.22□□□□□ -1.41
CEP170-211ENST00000468254 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.21□□□□□ -1.41
CEP170-211ENST00000468254 SCRIBQ14160 1630 aa6.21□□□□□ -1.42
CEP170-211ENST00000468254 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.21□□□□□ -1.42
CEP170-211ENST00000468254 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.2□□□□□ -1.42
CEP170-211ENST00000468254 KLHL34Q8N239 644 aa6.2□□□□□ -1.42
CEP170-211ENST00000468254 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CEP170-211ENST00000468254 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CEP170-211ENST00000468254 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.15□□□□□ -1.42
CEP170-211ENST00000468254 CFAP44Q96MT7 982 aa6.15□□□□□ -1.43
CEP170-211ENST00000468254 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CEP170-211ENST00000468254 SMARCA4P51532 1647 aa6.13□□□□□ -1.43
CEP170-211ENST00000468254 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CEP170-211ENST00000468254 C14orf37Q86TY3 774 aa6.12□□□□□ -1.43
CEP170-211ENST00000468254 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa6.12□□□□□ -1.43
CEP170-211ENST00000468254 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.11□□□□□ -1.43
CEP170-211ENST00000468254 SMARCA2P51531 1590 aa6.11□□□□□ -1.43
CEP170-211ENST00000468254 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.43
CEP170-211ENST00000468254 SLC4A2P04920 1241 aa6.1□□□□□ -1.43
CEP170-211ENST00000468254 PKD2Q13563 968 aa6.08□□□□□ -1.44
CEP170-211ENST00000468254 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CEP170-211ENST00000468254 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
CEP170-211ENST00000468254 HMGXB3Q12766 1538 aa6.06□□□□□ -1.44
CEP170-211ENST00000468254 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CEP170-211ENST00000468254 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CEP170-211ENST00000468254 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CEP170-211ENST00000468254 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CEP170-211ENST00000468254 PRDM2Q13029 1718 aa6.03□□□□□ -1.44
CEP170-211ENST00000468254 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CEP170-211ENST00000468254 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CEP170-211ENST00000468254 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CEP170-211ENST00000468254 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.02□□□□□ -1.45
CEP170-211ENST00000468254 TRHP20396 242 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CEP170-211ENST00000468254 WIZO95785 1651 aa5.99□□□□□ -1.45
CEP170-211ENST00000468254 CECR2Q9BXF3 1484 aa5.99□□□□□ -1.45
CEP170-211ENST00000468254 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CEP170-211ENST00000468254 NCAPD3P42695 1498 aa5.98□□□□□ -1.45
CEP170-211ENST00000468254 NBR1Q14596 966 aa5.97□□□□□ -1.45
CEP170-211ENST00000468254 HRCP23327 699 aa5.97□□□□□ -1.45
CEP170-211ENST00000468254 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa5.95□□□□□ -1.46
CEP170-211ENST00000468254 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CEP170-211ENST00000468254 VASPP50552 380 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CEP170-211ENST00000468254 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CEP170-211ENST00000468254 RGL2O15211 777 aa5.89□□□□□ -1.47
CEP170-211ENST00000468254 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CEP170-211ENST00000468254 APLP2Q06481 763 aa5.88□□□□□ -1.47
CEP170-211ENST00000468254 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa5.88□□□□□ -1.47
CEP170-211ENST00000468254 ATXN8OSP0DMR3 200 aa5.88□□□□□ -1.47
CEP170-211ENST00000468254 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa5.88□□□□□ -1.47
CEP170-211ENST00000468254 ARID3AQ99856 593 aa5.87□□□□□ -1.47
CEP170-211ENST00000468254 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CEP170-211ENST00000468254 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa5.85□□□□□ -1.47
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