RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445077.1

RBMS3-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 3, human

TSL 3

Gene RBMS3, Length 448 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS3-208	ENST00000445077	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	19.7	■□□□□ 0.74
RBMS3-208	ENST00000445077	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		19.19	■□□□□ 0.66
RBMS3-208	ENST00000445077	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	16.86	■□□□□ 0.29
RBMS3-208	ENST00000445077	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		16.82	■□□□□ 0.28
RBMS3-208	ENST00000445077	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	16.72	■□□□□ 0.27
RBMS3-208	ENST00000445077	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		15.54	■□□□□ 0.08
RBMS3-208	ENST00000445077	FOXD1	Q16676	465 aa		15.52	■□□□□ 0.08
RBMS3-208	ENST00000445077	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		14.88	□□□□□ -0.03
RBMS3-208	ENST00000445077	ADRA2B	P18089	450 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RBMS3-208	ENST00000445077	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
RBMS3-208	ENST00000445077	HRC	P23327	699 aa		14.39	□□□□□ -0.11
RBMS3-208	ENST00000445077	MSH5	O43196	834 aa		14.34	□□□□□ -0.11
RBMS3-208	ENST00000445077	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
RBMS3-208	ENST00000445077	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	14.26	□□□□□ -0.13
RBMS3-208	ENST00000445077	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		14.26	□□□□□ -0.13
RBMS3-208	ENST00000445077	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		14.2	□□□□□ -0.14
RBMS3-208	ENST00000445077	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
RBMS3-208	ENST00000445077	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	14.15	□□□□□ -0.14
RBMS3-208	ENST00000445077	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		14.1	□□□□□ -0.15
RBMS3-208	ENST00000445077	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBMS3-208	ENST00000445077	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBMS3-208	ENST00000445077	MYT1	Q01538	1121 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBMS3-208	ENST00000445077	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBMS3-208	ENST00000445077	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBMS3-208	ENST00000445077	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RBMS3-208	ENST00000445077	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBMS3-208	ENST00000445077	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBMS3-208	ENST00000445077	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBMS3-208	ENST00000445077	TRIM41	Q8WV44	630 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBMS3-208	ENST00000445077	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RBMS3-208	ENST00000445077	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBMS3-208	ENST00000445077	ABCC9	O60706	1549 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBMS3-208	ENST00000445077	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS3-208	ENST00000445077	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RBMS3-208	ENST00000445077	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RBMS3-208	ENST00000445077	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RBMS3-208	ENST00000445077	KCNA4	P22459	653 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RBMS3-208	ENST00000445077	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RBMS3-208	ENST00000445077	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RBMS3-208	ENST00000445077	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBMS3-208	ENST00000445077	NACAD	O15069	1562 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBMS3-208	ENST00000445077	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RBMS3-208	ENST00000445077	EEA1	Q15075	1411 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBMS3-208	ENST00000445077	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RBMS3-208	ENST00000445077	POTED	Q86YR6	584 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBMS3-208	ENST00000445077	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
RBMS3-208	ENST00000445077	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RBMS3-208	ENST00000445077	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBMS3-208	ENST00000445077	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RBMS3-208	ENST00000445077	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
RBMS3-208	ENST00000445077	SCRIB	Q14160	1630 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RBMS3-208	ENST00000445077	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
RBMS3-208	ENST00000445077	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RBMS3-208	ENST00000445077	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13	□□□□□ -0.33
RBMS3-208	ENST00000445077	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
RBMS3-208	ENST00000445077	NEUROD1	Q13562	356 aa		12.98	□□□□□ -0.33
RBMS3-208	ENST00000445077	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
RBMS3-208	ENST00000445077	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
RBMS3-208	ENST00000445077	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBMS3-208	ENST00000445077	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RBMS3-208	ENST00000445077	APLP2	Q06481	763 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RBMS3-208	ENST00000445077	CEP162	Q5TB80	1403 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RBMS3-208	ENST00000445077	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBMS3-208	ENST00000445077	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
RBMS3-208	ENST00000445077	GOLGA3	Q08378	1498 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBMS3-208	ENST00000445077	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RBMS3-208	ENST00000445077	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBMS3-208	ENST00000445077	WIZ	O95785	1651 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBMS3-208	ENST00000445077	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBMS3-208	ENST00000445077	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RBMS3-208	ENST00000445077	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RBMS3-208	ENST00000445077	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
RBMS3-208	ENST00000445077	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RBMS3-208	ENST00000445077	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		12.67	□□□□□ -0.38
RBMS3-208	ENST00000445077	KIF21B	O75037	1637 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBMS3-208	ENST00000445077	SMARCA4	P51532	1647 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBMS3-208	ENST00000445077	SMARCA2	P51531	1590 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBMS3-208	ENST00000445077	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		12.66	□□□□□ -0.38
RBMS3-208	ENST00000445077	MIER1	Q8N108	512 aa		12.65	□□□□□ -0.38
RBMS3-208	ENST00000445077	CLIP1	P30622	1438 aa		12.64	□□□□□ -0.39
RBMS3-208	ENST00000445077	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
RBMS3-208	ENST00000445077	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		12.62	□□□□□ -0.39
RBMS3-208	ENST00000445077	SOGA1	O94964	1423 aa		12.62	□□□□□ -0.39
RBMS3-208	ENST00000445077	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
RBMS3-208	ENST00000445077	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
RBMS3-208	ENST00000445077	ABCC8	Q09428	1581 aa		12.56	□□□□□ -0.4
RBMS3-208	ENST00000445077	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		12.56	□□□□□ -0.4
RBMS3-208	ENST00000445077	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBMS3-208	ENST00000445077	NEFL	P07196	543 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBMS3-208	ENST00000445077	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBMS3-208	ENST00000445077	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBMS3-208	ENST00000445077	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RBMS3-208	ENST00000445077	CUX2	O14529	1486 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RBMS3-208	ENST00000445077	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RBMS3-208	ENST00000445077	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
RBMS3-208	ENST00000445077	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBMS3-208	ENST00000445077	CCER2	I3L3R5	266 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RBMS3-208	ENST00000445077	SLC4A2	P04920	1241 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RBMS3-208	ENST00000445077	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		12.4	□□□□□ -0.42
RBMS3-208	ENST00000445077	MAP3K1	Q13233	1512 aa		12.4	□□□□□ -0.42

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