RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000189514.1

6030407O03Rik-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene 6030407O03Rik, Length 2,094 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 NischQ80TM9 1593 aa22.73■■□□□ 1.23
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa22.49■■□□□ 1.19
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Abcc9P70170 1546 aa22.09■■□□□ 1.13
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa21.92■■□□□ 1.1
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Abcc8B2RUS7 1588 aa21.63■■□□□ 1.05
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Rhox8Q6VSS7 320 aa20.9■□□□□ 0.94
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Chic1Q8CBW7 227 aa20.63■□□□□ 0.89
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Rtl1Q7M732 1744 aa20.6■□□□□ 0.89
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 ScribQ80U72 1612 aa20.48■□□□□ 0.87
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Dcaf1Q80TR8 1506 aa20.21■□□□□ 0.83
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Ccdc180J3QNE4 1664 aa20.19■□□□□ 0.82
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Kdm5dQ62240 1548 aa19.91■□□□□ 0.78
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa19.9■□□□□ 0.78
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 NacadQ5SWP3 1504 aa19.78■□□□□ 0.76
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Baz1aO88379 1555 aa19.69■□□□□ 0.74
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Crybg2B7ZCC2 1516 aa19.39■□□□□ 0.7
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Sycp2Q9CUU3 1500 aa19.39■□□□□ 0.7
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa19.38■□□□□ 0.69
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 HrcG5E8J6 738 aa19.28■□□□□ 0.68
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Smarca2Q6DIC0 1577 aa19.24■□□□□ 0.67
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 BicraF8VPZ9 1578 aa19.1■□□□□ 0.65
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Trim41Q5NCC3 630 aa19.07■□□□□ 0.64
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa18.82■□□□□ 0.6
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa18.77■□□□□ 0.59
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Cep164Q5DU05 1446 aa18.73■□□□□ 0.59
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Synj1Q8CHC4 1574 aa18.6■□□□□ 0.57
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Cngb1E1AZ71 1325 aa18.56■□□□□ 0.56
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Golga3P55937 1487 aa18.55■□□□□ 0.56
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 CftrP26361 1476 aa18.52■□□□□ 0.55
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa18.42■□□□□ 0.54
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa18.39■□□□□ 0.54
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Top2bQ64511 1612 aa18.34■□□□□ 0.53
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Phf23Q8BSN5 401 aa18.27■□□□□ 0.52
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa18.27■□□□□ 0.52
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Gab3Q8BSM5 595 aa18.26■□□□□ 0.51
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa18.13■□□□□ 0.49
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Myt1Q8CFC2 1127 aa18.08■□□□□ 0.49
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Fmn1Q05860 1466 aa18.08■□□□□ 0.48
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Wdr62Q3U3T8 1523 aa17.99■□□□□ 0.47
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Frmpd1A2AKB4 1549 aa17.98■□□□□ 0.47
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Ercc6F8VPZ5 1481 aa17.97■□□□□ 0.47
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa17.95■□□□□ 0.46
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Unc13aQ4KUS2 1712 aa17.91■□□□□ 0.46
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Pcgf6Q99NA9 353 aa17.83■□□□□ 0.45
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 TnnQ80Z71 1560 aa17.81■□□□□ 0.44
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Cep162Q6ZQ06 1403 aa17.79■□□□□ 0.44
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Mier1Q5UAK0 511 aa17.71■□□□□ 0.43
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa17.69■□□□□ 0.42
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Lamc3Q9R0B6 1581 aa17.68■□□□□ 0.42
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Fam135aQ6NS59 1506 aa17.67■□□□□ 0.42
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Npm2Q80W85 207 aa17.67■□□□□ 0.42
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 NefmP08553 848 aa17.66■□□□□ 0.42
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Myt1lP97500 1187 aa17.64■□□□□ 0.41
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Kif15Q6P9L6 1387 aa17.58■□□□□ 0.41
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 NrkQ9R0G8 1455 aa17.54■□□□□ 0.4
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 UbtfP25976 765 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Arhgap35Q91YM2 1499 aa17.52■□□□□ 0.39
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Ubl4bQ9CQ84 188 aa17.51■□□□□ 0.39
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 PtprkP35822 1457 aa17.51■□□□□ 0.39
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Camsap1A2AHC3 1581 aa17.51■□□□□ 0.39
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Clip1Q922J3 1391 aa17.5■□□□□ 0.39
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 CenpbP27790 599 aa17.49■□□□□ 0.39
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Shroom4Q1W617 1475 aa17.46■□□□□ 0.39
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Il27Q8K3I6 234 aa17.46■□□□□ 0.39
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Ccdc18Q640L5 1455 aa17.43■□□□□ 0.38
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Zeb1Q64318 1117 aa17.4■□□□□ 0.38
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Map3k1P53349 1493 aa17.39■□□□□ 0.38
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Grin2bQ01097 1482 aa17.39■□□□□ 0.38
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Cux2P70298 1426 aa17.38■□□□□ 0.37
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Eea1Q8BL66 1411 aa17.35■□□□□ 0.37
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa17.34■□□□□ 0.37
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Arap1Q4LDD4 1452 aa17.3■□□□□ 0.36
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa17.29■□□□□ 0.36
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Baz1bQ9Z277 1479 aa17.28■□□□□ 0.36
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Mrc2Q64449 1479 aa17.27■□□□□ 0.36
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Setd5Q5XJV7 1441 aa17.27■□□□□ 0.35
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa17.26■□□□□ 0.35
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa17.25■□□□□ 0.35
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Efcab5A0JP43 1406 aa17.21■□□□□ 0.35
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Kif21aQ9QXL2 1672 aa17.2■□□□□ 0.34
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.8 ms