RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173141.1

Gm20546-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20546, Length 1,889 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa30.92■■■□□ 2.54
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Gm20546-201ENSMUST00000173141 Sycp2Q9CUU3 1500 aa27.19■■□□□ 1.94
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Gm20546-201ENSMUST00000173141 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa25.67■■□□□ 1.7
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Gm20546-201ENSMUST00000173141 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa25.44■■□□□ 1.66
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Fam135aQ6NS59 1506 aa25.38■■□□□ 1.65
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Wdr62Q3U3T8 1523 aa25.27■■□□□ 1.64
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Gm20546-201ENSMUST00000173141 Mrc2Q64449 1479 aa24.83■■□□□ 1.57
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Gm20546-201ENSMUST00000173141 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa24.72■■□□□ 1.55
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Synj1Q8CHC4 1574 aa24.7■■□□□ 1.54
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Gm20546-201ENSMUST00000173141 Cux2P70298 1426 aa24.35■■□□□ 1.49
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa24.32■■□□□ 1.48
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa24.31■■□□□ 1.48
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Gm20546-201ENSMUST00000173141 Kif21aQ9QXL2 1672 aa24.2■■□□□ 1.46
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Gm20546-201ENSMUST00000173141 Shroom2A2ALU4 1481 aa23.8■■□□□ 1.4
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Plb1Q3TTY0 1478 aa23.79■■□□□ 1.4
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ccdc18Q640L5 1455 aa23.78■■□□□ 1.4
Gm20546-201ENSMUST00000173141 TnnQ80Z71 1560 aa23.71■■□□□ 1.39
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Gm20546-201ENSMUST00000173141 Top2bQ64511 1612 aa23.64■■□□□ 1.38
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Camsap1A2AHC3 1581 aa23.63■■□□□ 1.37
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Gm20546-201ENSMUST00000173141 Setd1bQ8CFT2 1985 aa23.24■■□□□ 1.31
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Samd9lQ69Z37 1561 aa23.22■■□□□ 1.31
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa23.2■■□□□ 1.3
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Efcab5A0JP43 1406 aa23.17■■□□□ 1.3
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Gm20546-201ENSMUST00000173141 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Grin2aP35436 1464 aa23.04■■□□□ 1.28
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Fgd6Q69ZL1 1399 aa23.03■■□□□ 1.28
Gm20546-201ENSMUST00000173141 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Magi3Q9EQJ9 1476 aa23.02■■□□□ 1.28
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Adgrl3Q80TS3 1537 aa23■■□□□ 1.27
Gm20546-201ENSMUST00000173141 PtprkP35822 1457 aa22.99■■□□□ 1.27
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa22.99■■□□□ 1.27
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa22.96■■□□□ 1.27
Gm20546-201ENSMUST00000173141 NrkQ9R0G8 1455 aa22.95■■□□□ 1.27
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa22.95■■□□□ 1.26
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gm156Q58A37 223 aa22.94■■□□□ 1.26
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa22.94■■□□□ 1.26
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Cep170Q6A065 1588 aa22.93■■□□□ 1.26
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Gm20546-201ENSMUST00000173141 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa22.91■■□□□ 1.26
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