RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTI1	O43156	1089 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	KATNA1	O75449	491 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	ITGB2	P05107	769 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	PVR	P15151	417 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD9	P21926	228 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP4F2	P78329	520 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPR135	Q8IZ08	494 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNF8	Q96H20	258 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR2A14	Q96R47	310 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		16.03	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	BPTF	Q12830	3046 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A0J9YY10	115 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	RASGRF2	O14827	1237 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	TIAF1	O95411	115 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	TPBGL	P0DKB5	382 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCN2	P20062	427 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP2A7	P20853	494 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	PKLR	P30613	574 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC1A2	P43004	574 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARL4C	P56559	192 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	CRYM	Q14894	314 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM73	Q86UV7	250 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	16.02	■□□□□ 0.16	5e-7	■■■□□ 17.1
JMJD1C-211	ENST00000633035	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	BBOF1	Q8ND07	529 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTC9	Q92623	222 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	CATSPER2	Q96P56	530 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	LHX9	Q9NQ69	397 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	CROT	Q9UKG9	612 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	NFS1	Q9Y697	457 aa		16.02	■□□□□ 0.16
JMJD1C-211	ENST00000633035	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035		E7EQ34	232 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	C1orf105	O95561	183 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERVK-10	P10266	1014 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	IVD	P26440	423 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP5D	P30049	168 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	BDKRB1	P46663	353 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	ITGA8	P53708	1063 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	ITGA1	P56199	1179 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	HIF1A	Q16665	826 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	C16orf46	Q6P387	395 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	STARD8	Q92502	1023 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNJ9	Q92806	393 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	EXTL1	Q92935	676 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	MR1	Q95460	341 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRRC39	Q96DD0	335 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	CFAP36	Q96G28	342 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL17F	Q96PD4	163 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL17B	Q9UHF5	180 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		16.01	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	NKX2-8	O15522	239 aa		16	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	VPS26A	O75436	327 aa		16	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	BANF1	O75531	89 aa		16	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	HAUS5	O94927	633 aa		16	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	HBQ1	P09105	142 aa		16	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	MSL3P1	P0C860	447 aa		16	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRKAR1A	P10644	381 aa		16	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	ELK3	P41970	407 aa		16	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	MPP1	Q00013	466 aa		16	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		16	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	LY6D	Q14210	128 aa		16	■□□□□ 0.15
JMJD1C-211	ENST00000633035	MSS51	Q4VC12	460 aa		16	■□□□□ 0.15

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