RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	SNF8	Q96H20	258 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRT12	Q99456	494 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	MENT	Q9BUN1	341 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	XKR8	Q9H6D3	395 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	FGF21	Q9NSA1	209 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	RARRES3	Q9UL19	164 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM187A	A6NFU0	413 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	TP73	O15350	636 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAP3K7	O43318	606 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPAG6	O75602	509 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	MATN4	O95460	622 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	EBLN1	P0CF75	366 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHRM3	P20309	590 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	PKLR	P30613	574 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCNF	P41002	786 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC1A2	P43004	574 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	ITGA8	P53708	1063 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	CTBP1	Q13363	440 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	KIR2DS3	Q14952	304 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	TTC23L	Q6PF05	361 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPESP1	Q6UW49	350 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	VASH2	Q86V25	355 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCNMB4	Q86W47	210 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	ESX1	Q8N693	406 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	BBOF1	Q8ND07	529 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCNJ9	Q92806	393 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	PPM1M	Q96MI6	270 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	FOPNL	Q96NB1	174 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR2A14	Q96R47	310 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	NRTN	Q99748	197 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRIM4	Q9C037	500 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501		E5RI56	91 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	C1orf105	O95561	183 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	MT-ND3	P03897	115 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF28	P17035	718 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	CD9	P21926	228 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	CLCN7	P51798	805 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARL4C	P56559	192 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	GRB7	Q14451	532 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	HIF1A	Q16665	826 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	BBS9	Q3SYG4	887 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	GALNT7	Q86SF2	657 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	FANCE	Q9HB96	536 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	WDR70	Q9NW82	654 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATM	Q13315	3056 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	PTPN13	Q12923	2485 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	RASGRF2	O14827	1237 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	BANF1	O75531	89 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	KIAA0754	O94854	1291 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	HAUS5	O94927	633 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	ERVK-10	P10266	1014 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	LIF	P15018	202 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	ST6GAL1	P15907	406 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	UGT2B7	P16662	529 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	ELK3	P41970	407 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	STAT5A	P42229	794 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CSNK1D-208	ENST00000578501	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3

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