RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 GNG11P61952 73 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRAMEP78395 509 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRADDP78560 199 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSPA14Q0VDF9 509 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITIH4Q14624 930 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 NCF4Q15080 339 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 NADK2Q4G0N4 442 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 MLIPQ5VWP3 458 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PACS1Q6VY07 963 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF534Q76KX8 674 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 VRK3Q8IV63 474 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CARFQ8N187 725 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC89Q8N998 374 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 THAP4Q8WY91 577 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 MIB2Q96AX9 1013 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR2A14Q96R47 310 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 NLNQ9BYT8 704 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDYLQ9Y232 598 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.93□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 QSOX1O00391 747 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP8B1O43520 1251 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALOX12BO75342 701 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC175P0C221 793 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GNLYP22749 145 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACADLP28330 430 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PKLRP30613 574 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCR7P32248 378 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 BDKRB1P46663 353 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMED2Q15363 201 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CES3Q6UWW8 571 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRGPREQ86SM8 312 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATCAYQ86WG3 371 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB43Q86YS6 212 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZBTB2Q8N680 514 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR4L1Q8NH43 312 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEC14L1Q92503 715 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 COL26A1Q96A83 441 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM136AQ96C01 138 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRFN5Q96NI6 719 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 NUDT9Q9BW91 350 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CARD6Q9BX69 1037 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 MED13Q9UHV7 2174 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 BLACEA4D250 179 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRT86O43790 486 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SUN1O94901 812 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 APOA4P06727 396 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GSTM1P09488 218 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 AGXTP21549 392 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADRA1DP25100 572 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 MCM3P25205 808 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSMB5P28074 263 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 NMBRP28336 390 aa6.91□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms