RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556170.5

NEK9-209, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 5

Gene NEK9, Length 3,975 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-209ENST00000556170 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 H3BM21 787 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 TYRP14679 529 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 CAPGP40121 348 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 ETV3P41162 512 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 HK3P52790 923 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 TEAD2Q15562 447 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 OR2T11Q8NH01 316 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 SLC32A1Q9H598 525 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 NTHL1P78549 312 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 YAF2Q8IY57 180 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 REEP1Q9H902 201 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 AMBNQ9NP70 447 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 PRKAB1Q9Y478 270 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.51□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 PLOD2O00469 737 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 TLL1O43897 1013 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 IL7RP16871 459 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 PLD3Q8IV08 490 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 HS3ST5Q8IZT8 346 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 MUS81Q96NY9 551 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 FANCEQ9HB96 536 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 TGM5O43548 720 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 RAP2AP10114 183 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 GPC1P35052 558 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 ATP4BP51164 291 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 CLCN4P51793 760 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 PIGFQ07326 219 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 ZFAND2BQ8WV99 257 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 SLC13A4Q9UKG4 626 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 FAM20BO75063 409 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 TFAP2AP05549 437 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 HLA-EP13747 358 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 EPORP19235 508 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 ELK4P28324 431 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 C17orf50Q8WW18 174 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 OTULINQ96BN8 352 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 VAPAQ9P0L0 249 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 ZNF232Q9UNY5 417 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 PTPRFP10586 1907 aa14.5□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 IL6P05231 212 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 UMPSP11172 480 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 BCKDHAP12694 445 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 ACRV1P26436 265 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 ALDH4A1P30038 563 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 BROXQ5VW32 411 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 Q6ZSR9 355 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 NELL1Q92832 810 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 COQ6Q9Y2Z9 468 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 PITPNM1O00562 1244 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 XYLBO75191 536 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 RORBQ92753 470 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 LHX3Q9UBR4 397 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 E2F3O00716 465 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 B4GAT1O43505 415 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 PDYNP01213 254 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 PRKAG1P54619 331 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 CPTPQ5TA50 214 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 FRG2Q64ET8 278 aa14.49□□□□□ -0.09
NEK9-209ENST00000556170 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms