RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550233.1

TMEM116-211, Transcript of transmembrane protein 116, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene TMEM116, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM116-211ENST00000550233 GPR173Q9NS66 373 aa4.61□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP4.61□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.61□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa4.61□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa4.61□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 YIPF1Q9Y548 306 aa4.61□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 A0A0B4J203 849 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 CLRN2A0PK11 232 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 PRR32B1ATL7 298 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 TEX28O15482 410 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 RPS6KA5O75582 802 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 PALMO75781 387 aa4.6□□□□□ -1.67
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TMEM116-211ENST00000550233 KRT5P13647 590 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 ARSBP15848 533 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 NAGAP17050 411 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 DNAJB1P25685 340 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 CERS1P27544 350 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 CHRNA3P32297 505 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 PLA2G5P39877 138 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 MAGEA4P43358 317 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 PSMC4P43686 418 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 ENTPD1P49961 510 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 NHLH1Q02575 133 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 SLC34A1Q06495 639 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 SULT2A1Q06520 285 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 EFEMP1Q12805 493 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 TROAPQ12815 778 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 FOXF2Q12947 444 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
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TMEM116-211ENST00000550233 PTGISQ16647 500 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 RAB6CQ53S08 254 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 CES4AQ5XG92 561 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 AFTPHQ6ULP2 937 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 LINGO4Q6UY18 593 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 B3GLCTQ6Y288 498 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 TAF8Q7Z7C8 310 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 NUDT13Q86X67 352 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 P2RX5Q93086 422 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 SSX3Q99909 188 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 PRRG4Q9BZD6 226 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 RAB6CQ9H0N0 254 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa4.6□□□□□ -1.67
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TMEM116-211ENST00000550233 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 U3KQV3 271 aa4.6□□□□□ -1.67
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TMEM116-211ENST00000550233 PRAG1Q86YV5 1406 aa4.6□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 A0A1W2PP11 408 aa4.59□□□□□ -1.67
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TMEM116-211ENST00000550233 TMEM150CB9EJG8 249 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 MAGEB2O15479 319 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 CLDN3O15551 220 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 NDUFS7O75251 213 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 GAGE7O76087 117 aa4.59□□□□□ -1.67
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TMEM116-211ENST00000550233 SOX30O94993 753 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 UBE4BO95155 1302 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 FGF2P09038 288 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 MMP10P09238 476 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 GAGE12FP0CL80 117 aa4.59□□□□□ -1.67
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TMEM116-211ENST00000550233 GAGE12IP0CL82 117 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 KRT13P13646 458 aa4.59□□□□□ -1.67
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TMEM116-211ENST00000550233 RPA1P27694 616 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 PTGER4P35408 488 aa4.59□□□□□ -1.67
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TMEM116-211ENST00000550233 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 GALK2Q01415 458 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 GAGE1Q13065 139 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 GAGE4Q13068 117 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 KIF19Q2TAC6 998 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 SYT14P1Q58G82 188 aa4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TMEM116-211ENST00000550233 KLC3Q6P597 504 aa4.59□□□□□ -1.67
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