RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528999.5

PUF60-213, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 3

Gene PUF60, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-213	ENST00000528999	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	PRSS23	O95084	383 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	CSPG5	O95196	566 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	TFAP2A	P05549	437 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	PGR	P06401	933 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	CISD3	P0C7P0	127 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	RAP2A	P10114	183 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	BCKDHA	P12694	445 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	JUP	P14923	745 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	SYN1	P17600	705 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	EPOR	P19235	508 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	PRPS1L1	P21108	318 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	MYF6	P23409	242 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	S100A3	P33764	101 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	HNF4A	P41235	474 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	CASP2	P42575	452 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	TRPC1	P48995	793 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	POLE2	P56282	527 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	MYBPC1	Q00872	1141 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	CHRNB3	Q05901	458 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	APOF	Q13790	326 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	EML3	Q32P44	896 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	ARSI	Q5FYB1	569 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	RABL3	Q5HYI8	236 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999		Q6ZVU0	165 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	LIX1	Q8N485	282 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	TTC16	Q8NEE8	873 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	TMIE	Q8NEW7	156 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	POF1B	Q8WVV4	589 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	HERVK_113	Q902F9	699 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	GLMN	Q92990	594 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF583	Q96ND8	569 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	HHIP	Q96QV1	700 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	SLC29A1	Q99808	456 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	CIB1	Q99828	191 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	CHID1	Q9BWS9	393 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	OLAH	Q9NV23	265 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	HIDE1	A8MVS5	230 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999		H3BNH8	94 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	ACOX3	O15254	700 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	CLOCK	O15516	846 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	SGTA	O43765	313 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	ATG13	O75143	517 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	LEFTY1	O75610	366 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	ADH1C	P00326	375 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	HPR	P00739	348 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	PDYN	P01213	254 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	PRNP	P04156	253 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	RET	P07949	1114 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	HRH2	P25021	359 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	CTNNB1	P35222	781 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	GDF5	P43026	501 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	ST8SIA6	P61647	398 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	FPGS	Q05932	587 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	MERTK	Q12866	999 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	EPS8	Q12929	822 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	E2F2	Q14209	437 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	DHCR24	Q15392	516 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	NRF1	Q16656	503 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	SLC36A3	Q495N2	470 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	FRG2	Q64ET8	278 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	KRT80	Q6KB66	452 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PUF60-213	ENST00000528999	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		10.43	□□□□□ -0.74

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