RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SOX13Q9UN79 622 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAGEB16A2A368 324 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H3BMM5 538 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF749O43361 778 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR2B3O76000 313 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD63P08962 238 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PAMP19021 973 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD9P21926 228 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PKLRP30613 574 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CASRP41180 1078 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPS1Q13098 491 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM135Q86UB9 458 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM73Q86UV7 250 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VRK3Q8IV63 474 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRT222Q8N1A0 295 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CFAP61Q8NHU2 1237 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MFSD3Q96ES6 412 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RUFY1Q96T51 708 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM60AQ9NP50 221 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYBUQ9NX95 663 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TLK1Q9UKI8 766 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCFL5Q9UL49 500 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNX7Q9UNH6 387 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C9J4A7 227 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FKBP9O95302 570 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 S1PR4O95977 384 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRT14P02533 472 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MLNP12872 115 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARNTP27540 789 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TLE1Q04724 770 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNJ11Q14654 390 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZIC1Q15915 447 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCN10Q6JVE6 187 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAD51AP1Q96B01 352 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FOPNLQ96NB1 174 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RASGRF2O14827 1237 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ESR1P03372 595 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAPN1P07384 714 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCNFP41002 786 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GABRA4P48169 554 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VPS41P49754 854 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KLRB1Q12918 225 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NCF4Q15080 339 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYP1B1Q16678 543 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RHBDD2Q6NTF9 364 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CASC4Q6P4E1 433 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ASB18Q6ZVZ8 466 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MCUQ8NE86 351 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BIRC8Q96P09 236 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MENTQ9BUN1 341 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM4Q9C037 500 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TENM4Q6N022 2769 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H3BMH7 237 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AVILO75366 819 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP5DP30049 168 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms