RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 RASGRP3Q8IV61 690 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 FBXO39Q8N4B4 442 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 OR9A1PQ8NGU1 263 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 HMGCLL1Q8TB92 370 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 MCOLN3Q8TDD5 553 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC44A1Q8WWI5 657 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC77Q9BR77 488 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM54Q9BYV2 358 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 C1GALT1Q9NS00 363 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 FETUBQ9UGM5 382 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 LOXL2Q9Y4K0 774 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 GSAPA4D1B5 854 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 TRABD2BA6NFA1 517 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 ARHGEF33A8MVX0 844 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 BTN3A1O00481 513 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 MAP3K7O43318 606 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 JMJD7P0C870 316 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 CRABP2P29373 138 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 BDKRB1P46663 353 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB10P61026 200 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 GRB7Q14451 532 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 SNAP47Q5SQN1 464 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 CACHD1Q5VU97 1274 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC12A9Q9BXP2 914 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 B3GNT4Q9C0J1 378 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 TWSG1Q9GZX9 223 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 XKR8Q9H6D3 395 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 PARVBQ9HBI1 364 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 ACTR10Q9NZ32 417 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL3Q9UH77 587 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF180Q9UJW8 692 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 SATB2Q9UPW6 733 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 BTN3A3O00478 584 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT38O76015 456 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 DXOO77932 396 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 TSPAN12O95859 305 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 HIST1H2ADP20671 130 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 MPSTP25325 297 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 MSH2P43246 934 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 GABREP78334 506 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 C3orf38Q5JPI3 329 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 LGSNQ5TDP6 509 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM92BQ6ZTR7 304 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL6Q8WZ60 621 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 HIST1H2AJQ99878 128 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 H2AFJQ9BTM1 129 aa25.98■■□□□ 1.75
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SH3BP2-212ENST00000508338 B4E171 279 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 TPBGLP0DKB5 382 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 MYBL2P10244 700 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC26A3P40879 764 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 TSPAN7P41732 249 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 AP1S2P56377 157 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 VSNL1P62760 191 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 C16orf72Q14CZ0 275 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 CYP2A13Q16696 494 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 EMBQ6PCB8 327 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 RCBTB1Q8NDN9 531 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 PAFAH2Q99487 392 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 PPCSQ9HAB8 311 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 DKK4Q9UBT3 224 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 PLAGL1Q9UM63 463 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 AK5Q9Y6K8 562 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 A8MU76 341 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 ERGP11308 486 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 CDH3P22223 829 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 ARL4DP49703 201 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB15P59190 212 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 SPESP1Q6UW49 350 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 MARCH9Q86YJ5 346 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 CEP97Q8IW35 865 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 GATA6Q92908 595 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC138Q96M89 665 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 PITPNM3Q9BZ71 974 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 DERL2Q9GZP9 239 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 KIF26BQ2KJY2 2108 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM8BA6NDV4 472 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM155BO75949 473 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP6V0D1P61421 351 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 NAA25Q14CX7 972 aa25.95■■□□□ 1.74
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