RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 VIPP01282 170 aa13.46□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 ALDH2P05091 517 aa13.46□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 FABP3P05413 133 aa13.46□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 GSTM2P28161 218 aa13.46□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 HOXD12P35452 270 aa13.46□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 GRK3P35626 688 aa13.46□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 TUBA3CQ13748 450 aa13.46□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 MFSD14CQ5VZR4 134 aa13.46□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 TUBA1CQ9BQE3 449 aa13.46□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa13.46□□□□□ -0.26
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SGMS1-203ENST00000429490 NRXN2Q9P2S2 1712 aa13.46□□□□□ -0.26
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SGMS1-203ENST00000429490 HTR3EA5X5Y0 456 aa13.45□□□□□ -0.26
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SGMS1-203ENST00000429490 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF197O14709 1029 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 KPNA5O15131 536 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 CHRNA1P02708 482 aa13.45□□□□□ -0.26
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SGMS1-203ENST00000429490 CKMP06732 381 aa13.45□□□□□ -0.26
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SGMS1-203ENST00000429490 GJA5P36382 358 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 NFKB2Q00653 900 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 SPIBQ01892 262 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
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SGMS1-203ENST00000429490 ARRDC2Q8TBH0 407 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 SLC22A17Q8WUG5 538 aa13.45□□□□□ -0.26
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SGMS1-203ENST00000429490 BOCQ9BWV1 1114 aa13.45□□□□□ -0.26
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SGMS1-203ENST00000429490 TMEM248Q9NWD8 314 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 ADPRHL2Q9NX46 363 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 ABCD2Q9UBJ2 740 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 DNMT3LQ9UJW3 386 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 WNK3Q9BYP7 1800 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 C5orf58C9J3I9 102 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 SERPIND1P05546 499 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 PFKLP17858 780 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 GGT1P19440 569 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 HTR7P34969 479 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 ATP6V1E1P36543 226 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 TGFBR1P36897 503 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 CTSKP43235 329 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 OR2T5Q6IEZ7 315 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 COLGALT2Q8IYK4 626 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 OR2T29Q8NH02 315 aa13.45□□□□□ -0.26
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SGMS1-203ENST00000429490 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 SMIM30A4D0T7 59 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 TSC22D2O75157 780 aa13.45□□□□□ -0.26
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SGMS1-203ENST00000429490 WEE1P30291 646 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 PTGER3P43115 390 aa13.45□□□□□ -0.26
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SGMS1-203ENST00000429490 UAP1L1Q3KQV9 507 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 C11orf96Q7Z7L8 435 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 RBFAQ8N0V3 343 aa13.45□□□□□ -0.26
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SGMS1-203ENST00000429490 KLHDC9Q8NEP7 349 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 CD84Q9UIB8 345 aa13.45□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 SUV39H1O43463 412 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 ACSL4O60488 711 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 PRAMEF11O60813 436 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 ADAM23O75077 832 aa13.44□□□□□ -0.26
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SGMS1-203ENST00000429490 STARD3Q14849 445 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 TIGD6Q17RP2 521 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 CYHR1Q6ZMK1 362 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 PYURFQ96I23 114 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 VPS35Q96QK1 796 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF382Q96SR6 550 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 RPS6KA6Q9UK32 745 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 SNX6Q9UNH7 406 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 MYADML2A6NDP7 307 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 CLIC1O00299 241 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 SERPINB7O75635 380 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 RAB15P59190 212 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 CDK5R2Q13319 367 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 VEPH1Q14D04 833 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 ARMC8Q8IUR7 673 aa13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SGMS1-203ENST00000429490 SCAIQ8N9R8 606 aa13.44□□□□□ -0.26
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