RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 WDR47O94967 919 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 SEMA3DO95025 777 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 ALPLP05186 524 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 OR1E1P30953 314 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 CREB5Q02930 508 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 SLC10A7Q0GE19 358 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 CLCA4Q14CN2 919 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 TJAP1Q5JTD0 557 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 CAMKK1Q8N5S9 505 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 PIK3C3Q8NEB9 887 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 ZUFSPQ96AP4 578 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 HMCESQ96FZ2 354 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 SP110Q9HB58 689 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM161AQ9NX61 479 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 MALT1Q9UDY8 824 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 A0A0D9SEW6 157 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 A0A1W2PQ72 361 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 MTMR11A4FU01 709 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 CDC7O00311 574 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 PRRG1O14668 218 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 ICMTO60725 284 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 F9P00740 461 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 HRH2P25021 359 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 PRKG2Q13237 762 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 RAB41Q5JT25 222 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 ERAP2Q6P179 960 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 LIMS2Q7Z4I7 341 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 SPRED1Q7Z699 444 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 FBXO22Q8NEZ5 403 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 CASD1Q96PB1 797 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 HOXD1Q9GZZ0 328 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 TUBB1Q9H4B7 451 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 MARCH5Q9NX47 278 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 PCDHB8Q9UN66 801 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 ITM2BQ9Y287 266 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 FHP07954 510 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 G6PDP11413 515 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 IMPDH1P20839 514 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 ARHGDIAP52565 204 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 HMGCS1Q01581 520 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 DSC2Q02487 901 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 PWP1Q13610 501 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 MED22Q15528 200 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 BCL2A1Q16548 175 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 AP5B1Q2VPB7 878 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 NXNL2Q5VZ03 156 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 SYCE2Q6PIF2 218 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 HORMAD1Q86X24 394 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 LYSMD2Q8IV50 215 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 OR7D4Q8NG98 312 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 PXYLP1Q8TE99 480 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 RMDN1Q96DB5 314 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 TSPAN17Q96FV3 270 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 DOK1Q99704 481 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 A0A1W2PP18 115 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 SERPINA1P01009 418 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 VIPP01282 170 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF404Q494X3 552 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 ANKS6Q68DC2 871 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 CYHR1Q6ZMK1 362 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 OR13C4Q8NGS5 318 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 NT5C3BQ969T7 300 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 NEDD4LQ96PU5 975 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 EGFL8Q99944 293 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 TTPALQ9BTX7 342 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 AKIP1Q9NQ31 210 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 UCKL1Q9NWZ5 548 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 ZW10O43264 779 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 RGS10O43665 173 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 HLA-DQB2P05538 268 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 RAP2AP10114 183 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 HTR2BP41595 481 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 IRF5Q13568 498 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 OR4D1Q15615 310 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 FBXL22Q6P050 247 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM207Q6UWW9 146 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 METTL4Q8N3J2 472 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-202ENST00000409251 TUBA1CQ9BQE3 449 aa12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms