RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRRD1A4D1F6 860 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAGEA13PA6NCF6 341 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 DUXAA6NLW8 204 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMTNL1A8MU46 457 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF263O14978 683 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ST8SIA3O43173 380 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP6AP2O75787 350 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 PGLSO95336 258 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 RLN1P04808 185 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 INHBAP08476 426 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMIM18P0DKX4 95 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPP1P10451 314 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDH1P12830 882 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CKMT2P17540 419 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 LBPP18428 481 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNJ1P48048 391 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 RGS7P49802 495 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 MFAP3P55082 362 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 MTCP1P56278 107 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ASIC1P78348 528 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CX3CL1P78423 397 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 MBTD1Q05BQ5 628 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 LTBQ06643 244 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 COASYQ13057 564 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SNTA1Q13424 505 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 TAZQ16635 292 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CA9Q16790 459 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 DUOXA1Q1HG43 343 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 UGT3A2Q3SY77 523 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF260Q3ZCT1 412 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRRC73Q5JTD7 316 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SUSD4Q5VX71 490 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CREB3L2Q70SY1 520 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 LONP2Q86WA8 852 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SFR1Q86XK3 245 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 IQCF1Q8N6M8 205 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPC24Q8NBT2 197 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 UXS1Q8NBZ7 420 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNH5Q8NCM2 988 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 DBF4BQ8NFT6 615 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR7G3Q8NG95 312 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR13J1Q8NGT2 312 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC107Q8WV48 283 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 RIT1Q92963 219 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 TEKT1Q969V4 418 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CABS1Q96KC9 395 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SGK494Q96LW2 274 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 C17orf77Q96MU5 243 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 RETREG1Q9H6L5 497 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM206Q9H813 350 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 MINDY3Q9H8M7 445 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 Q9H8V8 135 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 DBNDD1Q9H9R9 158 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 GKN1Q9NS71 199 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADPRHL2Q9NX46 363 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CNIH4Q9P003 139 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SEPT10Q9P0V9 454 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CACNG4Q9UBN1 327 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 HEG1Q9ULI3 1381 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRAV24A0A0B4J272 114 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A1W2PPI3 338 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A1W2PRB8 838 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CASTOR2A6NHX0 329 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYMKA6NI61 221 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 E9PI62 339 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLOD2O00469 737 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPIP5K2O43314 1243 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 KINO60870 393 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 BAG4O95429 457 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP1R3DO95685 299 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 IGHV4-39P01824 125 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 DAOP14920 347 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 PSMB4P28070 264 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SOAT1P35610 550 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 HSD17B3P37058 310 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 CASP3P42574 277 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 FRKP42685 505 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 FUT6P51993 359 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 SNU13P55769 128 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 GSDMDP57764 484 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 RPS18P62269 152 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBXN1Q04323 297 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 DMPKQ09013 629 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF415Q09FC8 603 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 GAGE5Q13069 117 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-655P-201ENST00000362858 GAGE6Q13070 117 aa2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms