RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 KIFC1Q9BW19 673 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CARD6Q9BX69 1037 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 RAB17Q9H0T7 212 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 POLG2Q9UHN1 485 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 GNPTGQ9UJJ9 305 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 KCND3Q9UK17 655 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PADI1Q9ULC6 663 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SOX13Q9UN79 622 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CDYLQ9Y232 598 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PIPSLA2A3N6 862 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 IQCF5A8MTL0 148 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 B8ZZF3 427 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 C21orf140B9A014 251 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA8TH3BQL2 631 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 AVILO75366 819 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 KATNA1O75449 491 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 GPC4O75487 556 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFS3O75489 264 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 URI1O94763 535 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM63AO94886 807 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 VAPBO95292 243 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 RPN2P04844 631 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 MSL3P1P0C860 447 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TPBGLP0DKB5 382 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SFTPCP11686 197 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PVRP15151 417 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CD46P15529 392 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 UGT2B7P16662 529 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CYP2A7P20853 494 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ARNTP27540 789 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 AOAHP28039 575 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CCR10P46092 362 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CAV1Q03135 178 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 NFATC3Q12968 1075 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ABRQ12979 859 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CALCOCO2Q13137 446 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 KCNAB2Q13303 367 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 DNASE1L3Q13609 305 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 C16orf46Q6P387 395 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CASC4Q6P4E1 433 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CES3Q6UWW8 571 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 UNC5DQ6UXZ4 953 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM73Q86UV7 250 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC6Q86X45 466 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 VRK3Q8IV63 474 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL7Q8IXQ5 586 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PDIK1LQ8N165 341 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 KRT222Q8N1A0 295 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CEP112Q8N8E3 955 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CPT1BQ92523 772 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF592Q92610 1267 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 MFSD3Q96ES6 412 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SNF8Q96H20 258 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PANX3Q96QZ0 392 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 P2RY12Q9H244 342 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ACTL8Q9H568 366 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SYTL2Q9HCH5 934 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 LHX9Q9NQ69 397 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 STARD5Q9NSY2 213 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SPHK1Q9NYA1 384 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 OR6C2Q9NZP2 312 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PLAGL1Q9UM63 463 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC88CQ9P219 2028 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 LRRK2Q5S007 2527 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0J9YY10 115 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CDC14CA4D256 554 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms