RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330149.9

TRAPPC6B-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6B, Length 3,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6B-201ENST00000330149 TUBA4AP68366 448 aa5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC6B-201ENST00000330149 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZBTB6Q15916 424 aa5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CYP2A13Q16696 494 aa5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC6B-201ENST00000330149 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC6B-201ENST00000330149 GRTP1Q5TC63 336 aa5.66□□□□□ -1.5
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZNF597Q96LX8 424 aa5.65□□□□□ -1.5
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 CPNE1Q99829 537 aa5.65□□□□□ -1.5
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 CYP4F12Q9HCS2 524 aa5.65□□□□□ -1.5
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 TOR4AQ9NXH8 423 aa5.65□□□□□ -1.5
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 HMGXB4Q9UGU5 601 aa5.65□□□□□ -1.5
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 RIMKLBQ9ULI2 386 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 DENND4CQ5VZ89 1909 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC6B-201ENST00000330149 PCDH15Q96QU1 1955 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC6B-201ENST00000330149 OBSL1O75147 1896 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC6B-201ENST00000330149 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC6B-201ENST00000330149 FAM234BA2RU67 622 aa5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC6B-201ENST00000330149 KRT87PA6NCN2 255 aa5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC6B-201ENST00000330149 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC6B-201ENST00000330149 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC6B-201ENST00000330149 H3BMQ9 156 aa5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC6B-201ENST00000330149 KCNK1O00180 336 aa5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC6B-201ENST00000330149 RNF103O00237 685 aa5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CBX4O00257 560 aa5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC6B-201ENST00000330149 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC6B-201ENST00000330149 SOCS2O14508 198 aa5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC6B-201ENST00000330149 AP3D1O14617 1153 aa5.65□□□□□ -1.51
TRAPPC6B-201ENST00000330149 UBDO15205 165 aa5.65□□□□□ -1.51
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