RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277657.12

CCDC7-201, Transcript of coiled-coil domain containing 7, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC7, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7-201ENST00000277657 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 MANBAO00462 879 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 EOGTQ5NDL2 527 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 AMZ2Q86W34 360 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 WDR60Q8WVS4 1066 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 OR52A5Q9H2C5 316 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 KLQ9UEF7 1012 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SLC23A2Q9UGH3 650 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PRKAB1Q9Y478 270 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PRR23AA6NEV1 266 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 FBP2O00757 339 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 FFAR3O14843 346 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 GPR42O15529 346 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ENTPD5O75356 428 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ULK1O75385 1050 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SLC16A8O95907 504 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ITPKAP23677 461 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 IMPA1P29218 277 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TMEM92Q6UXU6 159 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 OR56A3Q8NH54 315 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 FAM3CQ92520 227 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 HBEGFQ99075 208 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 NPAS2Q99743 824 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PRAMEF4O60810 478 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 EMX2Q04743 252 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PGAM4Q8N0Y7 254 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ASB12Q8WXK4 309 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 MMP17Q9ULZ9 603 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TBC1D3EA0A087X179 549 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TBC1D3LB9A6J9 549 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SLC28A1O00337 649 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TBC1D3HP0C7X1 549 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PCDH1Q08174 1060 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ART3Q13508 389 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 LRP8Q14114 963 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 RPS6KA2Q15349 733 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 SMU1Q2TAY7 513 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 REP15Q6BDI9 236 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 UNC5DQ6UXZ4 953 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 FNDC5Q8NAU1 212 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 TMEM45AQ9NWC5 275 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCDC7-201ENST00000277657 KLHL33A6NCF5 533 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 KMOO15229 486 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 RGS14O43566 566 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 UGDHO60701 494 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 CIB2O75838 187 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 KRT6AP02538 564 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 KRT6BP04259 564 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 NDUFV2P19404 249 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 IGFALSP35858 605 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 KRT6CP48668 564 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 MTTPP55157 894 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 NAE1Q13564 534 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 NR6A1Q15406 480 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 PDZD3Q86UT5 571 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 PPP3R2Q96LZ3 170 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 WDR41Q9HAD4 459 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 BBIP1A8MTZ0 92 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 NRP2O60462 931 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 SRFP11831 508 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 NME5P56597 212 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 AP5B1Q2VPB7 878 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 METRNLQ641Q3 311 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 FBXW8Q8N3Y1 598 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC7-201ENST00000277657 TSPEARQ8WU66 669 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 620.8 ms