RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc9a9Q8BZ00 644 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Panx3Q8CEG0 392 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lrrc20Q8CI70 184 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn1r79Q8R285 306 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lars2Q8VDC0 902 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pcdhgb2Q91XX7 928 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rad51cQ924H5 366 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rai2Q9QVY8 529 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Wfdc16A2A5H4 111 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Grin3aA2AIR5 1135 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm14692A2BH01 229 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm3259D3YUK0 475 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Adamts10P58459 1104 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cyp2d40Q6P8N9 338 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AtminQ6P9S1 818 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cpped1Q8BFS6 312 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plin5Q8BVZ1 463 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gde1Q9JL56 331 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Barx2O08686 283 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prl7a1O54830 266 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NadkP58058 439 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Proser1Q5PRE5 913 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DgkbQ6NS52 802 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp62Q8C827 914 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slco1a5Q91YY5 670 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Jag1Q9QXX0 1218 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mpp2Q9WV34 552 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kcnj12P52187 427 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc5a6Q5U4D8 634 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nars2Q8BGV0 477 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1278Q8VF39 313 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gfod2Q9CYH5 385 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm11634A0A1B0GSX1 172 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 GnazO70443 355 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lire1P11260 357 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atp5jP97450 108 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nol9Q3TZX8 714 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lgals12Q91VD1 314 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dusp12Q9D0T2 339 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cldn7Q9Z261 211 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TomtA1Y9I9 258 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Phf11bB4XVQ1 276 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc32a1O35633 525 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Man2a1P27046 1150 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gpr142Q7TQN9 365 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gsdmc3Q8CB12 480 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cstf1Q99LC2 431 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 GsdmcQ99NB5 468 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam187aQ9D3R5 417 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Osbpl3Q9DBS9 855 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Adam28Q9JLN6 793 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Col1a1P11087 1453 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr600E9PUN7 314 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r13L7N1X2 831 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hmx1O70218 332 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Chrna1P04756 457 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tbx5P70326 518 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ElocP83940 112 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sox4Q06831 440 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mtf1Q07243 675 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zc3h14Q8BJ05 735 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bpifb2Q8C1E1 462 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr371Q8VGB8 312 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Map4k3Q99JP0 894 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cep97Q9CZ62 856 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ap2a1P17426 977 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Six2Q62232 296 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppp3r1Q63810 170 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cars2Q8BYM8 551 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Actl6bQ99MR0 426 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Aldh7a1Q9DBF1 539 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fbxw5Q9QXW2 573 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1040A2ARY1 313 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 OcmP51879 109 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim69Q80X56 500 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Snx11Q91WL6 271 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AdprmQ99KS6 340 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r2L7N2E9 908 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ca12Q8CI85 354 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Serpinb7Q9D695 380 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ThegQ9JMB1 375 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Apol8A2VDH7 339 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Alkbh2Q6P6J4 239 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Agbl3Q8CDP0 1006 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr273Q8VG87 317 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ergic2Q9CR89 377 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Med31Q9CXU1 131 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Efcab1Q9D3N2 212 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eif3kQ9DBZ5 218 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hsd17b11Q9EQ06 298 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hipk3Q9ERH7 1192 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kng1O08677 661 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Spp1P10923 294 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PeloQ80X73 385 aa17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.1 ms