Protein–RNA interactions for Protein: O54830

Prl7a1, Prolactin-7A1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl7a1O54830 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Prl7a1O54830 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prl7a1O54830 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prl7a1O54830 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prl7a1O54830 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prl7a1O54830 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Prl7a1O54830 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prl7a1O54830 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prl7a1O54830 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prl7a1O54830 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Prl7a1O54830 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prl7a1O54830 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prl7a1O54830 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prl7a1O54830 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prl7a1O54830 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prl7a1O54830 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Prl7a1O54830 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prl7a1O54830 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prl7a1O54830 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prl7a1O54830 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prl7a1O54830 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Prl7a1O54830 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prl7a1O54830 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prl7a1O54830 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Prl7a1O54830 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prl7a1O54830 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prl7a1O54830 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prl7a1O54830 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prl7a1O54830 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prl7a1O54830 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prl7a1O54830 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prl7a1O54830 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prl7a1O54830 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prl7a1O54830 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prl7a1O54830 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Prl7a1O54830 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Prl7a1O54830 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prl7a1O54830 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prl7a1O54830 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prl7a1O54830 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prl7a1O54830 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prl7a1O54830 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prl7a1O54830 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prl7a1O54830 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Prl7a1O54830 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prl7a1O54830 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prl7a1O54830 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prl7a1O54830 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prl7a1O54830 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prl7a1O54830 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prl7a1O54830 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Prl7a1O54830 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prl7a1O54830 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prl7a1O54830 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Prl7a1O54830 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prl7a1O54830 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prl7a1O54830 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prl7a1O54830 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prl7a1O54830 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prl7a1O54830 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prl7a1O54830 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prl7a1O54830 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prl7a1O54830 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prl7a1O54830 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prl7a1O54830 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prl7a1O54830 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prl7a1O54830 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prl7a1O54830 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prl7a1O54830 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prl7a1O54830 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prl7a1O54830 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prl7a1O54830 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prl7a1O54830 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prl7a1O54830 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prl7a1O54830 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prl7a1O54830 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Prl7a1O54830 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prl7a1O54830 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prl7a1O54830 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prl7a1O54830 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prl7a1O54830 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prl7a1O54830 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prl7a1O54830 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prl7a1O54830 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prl7a1O54830 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prl7a1O54830 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prl7a1O54830 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prl7a1O54830 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prl7a1O54830 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prl7a1O54830 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prl7a1O54830 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prl7a1O54830 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prl7a1O54830 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prl7a1O54830 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prl7a1O54830 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prl7a1O54830 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prl7a1O54830 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prl7a1O54830 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prl7a1O54830 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prl7a1O54830 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms