Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ06

Hsd17b11, Estradiol 17-beta-dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsd17b11Q9EQ06 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Hsd17b11Q9EQ06 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hsd17b11Q9EQ06 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hsd17b11Q9EQ06 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hsd17b11Q9EQ06 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hsd17b11Q9EQ06 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hsd17b11Q9EQ06 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hsd17b11Q9EQ06 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hsd17b11Q9EQ06 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Hsd17b11Q9EQ06 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hsd17b11Q9EQ06 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Hsd17b11Q9EQ06 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hsd17b11Q9EQ06 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hsd17b11Q9EQ06 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hsd17b11Q9EQ06 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hsd17b11Q9EQ06 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hsd17b11Q9EQ06 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hsd17b11Q9EQ06 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hsd17b11Q9EQ06 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hsd17b11Q9EQ06 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hsd17b11Q9EQ06 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hsd17b11Q9EQ06 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hsd17b11Q9EQ06 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hsd17b11Q9EQ06 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hsd17b11Q9EQ06 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hsd17b11Q9EQ06 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hsd17b11Q9EQ06 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hsd17b11Q9EQ06 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hsd17b11Q9EQ06 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hsd17b11Q9EQ06 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hsd17b11Q9EQ06 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hsd17b11Q9EQ06 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hsd17b11Q9EQ06 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hsd17b11Q9EQ06 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hsd17b11Q9EQ06 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hsd17b11Q9EQ06 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hsd17b11Q9EQ06 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hsd17b11Q9EQ06 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hsd17b11Q9EQ06 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hsd17b11Q9EQ06 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hsd17b11Q9EQ06 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hsd17b11Q9EQ06 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hsd17b11Q9EQ06 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hsd17b11Q9EQ06 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hsd17b11Q9EQ06 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hsd17b11Q9EQ06 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hsd17b11Q9EQ06 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hsd17b11Q9EQ06 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hsd17b11Q9EQ06 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hsd17b11Q9EQ06 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hsd17b11Q9EQ06 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hsd17b11Q9EQ06 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hsd17b11Q9EQ06 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hsd17b11Q9EQ06 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hsd17b11Q9EQ06 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hsd17b11Q9EQ06 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hsd17b11Q9EQ06 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hsd17b11Q9EQ06 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hsd17b11Q9EQ06 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hsd17b11Q9EQ06 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hsd17b11Q9EQ06 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hsd17b11Q9EQ06 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hsd17b11Q9EQ06 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hsd17b11Q9EQ06 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hsd17b11Q9EQ06 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hsd17b11Q9EQ06 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hsd17b11Q9EQ06 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hsd17b11Q9EQ06 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hsd17b11Q9EQ06 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hsd17b11Q9EQ06 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hsd17b11Q9EQ06 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hsd17b11Q9EQ06 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hsd17b11Q9EQ06 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hsd17b11Q9EQ06 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hsd17b11Q9EQ06 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hsd17b11Q9EQ06 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hsd17b11Q9EQ06 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hsd17b11Q9EQ06 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hsd17b11Q9EQ06 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hsd17b11Q9EQ06 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hsd17b11Q9EQ06 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hsd17b11Q9EQ06 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hsd17b11Q9EQ06 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hsd17b11Q9EQ06 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hsd17b11Q9EQ06 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hsd17b11Q9EQ06 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hsd17b11Q9EQ06 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hsd17b11Q9EQ06 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hsd17b11Q9EQ06 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hsd17b11Q9EQ06 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hsd17b11Q9EQ06 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hsd17b11Q9EQ06 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hsd17b11Q9EQ06 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms