RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614494.1

TARDBP-216, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 515 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-216ENST00000614494 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.01□□□□□ -1.29
TARDBP-216ENST00000614494 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
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TARDBP-216ENST00000614494 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TARDBP-216ENST00000614494 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TARDBP-216ENST00000614494 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.01□□□□□ -1.29
TARDBP-216ENST00000614494 PLCL2Q9UPR0 1127 aa7.01□□□□□ -1.29
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TARDBP-216ENST00000614494 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.01□□□□□ -1.29
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TARDBP-216ENST00000614494 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.292e-14■■□□□ 12.4
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TARDBP-216ENST00000614494 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TARDBP-216ENST00000614494 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.99□□□□□ -1.29
TARDBP-216ENST00000614494 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.99□□□□□ -1.29
TARDBP-216ENST00000614494 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.99□□□□□ -1.29
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