RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592857.5

SLC25A39-216, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 3

Gene SLC25A39, Length 837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-216ENST00000592857 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 CAVIN3Q969G5 261 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 FERD3LQ96RJ6 166 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 FMO2Q99518 471 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 SLC25A18Q9H1K4 315 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 CASS4Q9NQ75 786 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 BTN3A3O00478 584 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 TCN2P20062 427 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 NSG1P42857 185 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 CCR10P46092 362 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ARL4DP49703 201 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ACVR1Q04771 509 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 KCNAB2Q13303 367 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 KRT33BQ14525 404 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ARMC6Q6NXE6 501 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 PCGF5Q86SE9 256 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 PHC3Q8NDX5 983 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 LCN9Q8WX39 176 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 CPT1BQ92523 772 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF778Q96MU6 729 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 RANBP9Q96S59 729 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 LHX9Q9NQ69 397 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 TUBD1Q9UJT1 453 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 MYO18BQ8IUG5 2567 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 HEATR9A2RTY3 570 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 MT-ND3P03897 115 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 GPR19Q15760 415 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 DEFB109BQ30KR1 87 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 TSTD2Q5T7W7 516 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 C16orf46Q6P387 395 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF534Q76KX8 674 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 PPIL6Q8IXY8 311 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 CT55Q8WUE5 264 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 FAM117AQ9C073 453 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 PADI1Q9ULC6 663 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 SPTBP11277 2137 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 BTN3A1O00481 513 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 NTRK1P04629 796 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 FURINP09958 794 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 PRKAA1Q13131 559 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 DNASE1L3Q13609 305 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 KCNJ11Q14654 390 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 MORF4L2Q15014 288 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 HOOK3Q86VS8 718 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 HDAC10Q969S8 669 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 HGH1Q9BTY7 390 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 GSAPA4D1B5 854 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 E7EVH7 732 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 MATN2O00339 956 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 QSOX1O00391 747 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 SUV39H1O43463 412 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 OR1I1O60431 355 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 CCNYL3P0C7X3 344 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 CDH3P22223 829 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ADRA1DP25100 572 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ACADLP28330 430 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 LMAN1P49257 510 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 PRKG2Q13237 762 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ELMO1Q92556 727 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 RUFY1Q96T51 708 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 XKR8Q9H6D3 395 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 KCND3Q9UK17 655 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 ICKQ9UPZ9 632 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A39-216ENST00000592857 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms