RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	GSAP	A4D1B5	854 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137		H3BMH7	237 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CREG1	O75629	220 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SCRG1	O75711	98 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KRT14	P02533	472 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	NTRK1	P04629	796 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	RPN2	P04844	631 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ST6GAL1	P15907	406 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MGAT1	P26572	445 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MAGEA3	P43357	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	GABRA4	P48169	554 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	DNASE1L3	Q13609	305 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	GRB7	Q14451	532 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KIR2DS3	Q14952	304 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	GPR19	Q15760	415 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TMEM135	Q86UB9	458 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	VRK3	Q8IV63	474 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CPT1B	Q92523	772 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	LPGAT1	Q92604	370 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MFSD3	Q96ES6	412 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TCTN2	Q96GX1	697 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MS4A14	Q96JA4	679 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	BIRC8	Q96P09	236 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	NRTN	Q99748	197 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	XKR8	Q9H6D3	395 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	FANCE	Q9HB96	536 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SYBU	Q9NX95	663 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137		H3BMM5	538 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PFDN6	O15212	129 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	NDUFS3	O75489	264 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	VAPB	O95292	243 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	FKBP9	O95302	570 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ESR1	P03372	595 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	UGT2B7	P16662	529 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ATP5D	P30049	168 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	RORA	P35398	523 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	FNTA	P49354	379 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	RAB28	P51157	221 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	POLE2	P56282	527 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	GPS2	Q13227	327 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KCNAB2	Q13303	367 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	GBX1	Q14549	363 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	BRD3	Q15059	726 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TMED2	Q15363	201 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SLC35F6	Q8N357	371 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	OR1L3	Q8NH93	324 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	COG1	Q8WTW3	980 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CT55	Q8WUE5	264 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SLCO2A1	Q92959	643 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SNX12	Q9UMY4	172 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137		A0A0J9YY10	115 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	IQCF5	A8MTL0	148 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MEN1	O00255	615 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PHF2	O75151	1096 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	AVIL	O75366	819 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TMEM63A	O94886	807 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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