RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa3.75□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa3.75□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 RNF215Q9Y6U7 377 aa3.75□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 A0A1W2PN81 502 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 AGAP14A8MT82 685 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 H7C423 109 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 CRLF1O75462 422 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 CEBPBP17676 345 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 ACSL1P33121 698 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 CHRNA7P36544 502 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 MAGEA11P43364 429 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 PRKCZQ05513 592 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 CHAF1BQ13112 559 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 SLC1A5Q15758 541 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 PHLDA2Q53GA4 152 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TEX38Q6PEX7 206 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 LINGO4Q6UY18 593 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 PIGZQ86VD9 579 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM139Q8IV31 216 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TAGAPQ8N103 731 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 ARHGAP24Q8N264 748 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 RAB42Q8N4Z0 105 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 AFAP1Q8N556 730 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TRIML1Q8N9V2 468 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 HPSE2Q8WWQ2 592 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 CALML4Q96GE6 196 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 NEK1Q96PY6 1258 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 NUP85Q9BW27 656 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM15Q9C019 465 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM181Q9P2C4 612 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 CACNG4Q9UBN1 327 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 VPS28Q9UK41 221 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 MTUS1Q9ULD2 1270 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 MMP24Q9Y5R2 645 aa3.74□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 WDR97A6NE52 1622 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 CEP164Q9UPV0 1460 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 ANKRD61A6NGH8 418 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TSPAN1O60635 241 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 MED24O75448 989 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 GJB3O75712 270 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TSPAN9O75954 239 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TYMPP19971 482 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 SAT1P21673 171 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 B3GALT5-AS1P59052 145 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 NR1D2Q14995 579 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 WTAPQ15007 396 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 RILPL1Q5EBL4 403 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 XKR6Q5GH73 641 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 FAM205BPQ63HN1 556 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 GTSCR1Q86UQ5 136 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 CEP57Q86XR8 500 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF614Q8N883 585 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 MOSPD2Q8NHP6 518 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 FGFBP3Q8TAT2 258 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 IRGQQ8WZA9 623 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 C18orf12Q96KH6 178 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 ATOH8Q96SQ7 321 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 VGLL1Q99990 258 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM51Q9BSJ1 452 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 UBXN6Q9BZV1 441 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 PSD3Q9NYI0 1048 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TBC1D29Q9UFV1 150 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TUBE1Q9UJT0 475 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 FANCD2Q9BXW9 1451 aa3.73□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 PDS5BQ9NTI5 1447 aa3.72□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 ANKUB1A6NFN9 424 aa3.72□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 MEIS2O14770 477 aa3.72□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 ADAMDEC1O15204 470 aa3.72□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 CSH1P0DML2 217 aa3.72□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 CSH2P0DML3 217 aa3.72□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 DNASE1P24855 282 aa3.72□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 SLC6A6P31641 620 aa3.72□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 HOXD13P35453 343 aa3.72□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 PSMC6P62333 389 aa3.72□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 TEAD2Q15562 447 aa3.72□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 LPAL2Q16609 132 aa3.72□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa3.72□□□□□ -1.81
CPEB4-210ENST00000522344 CEP57L1Q8IYX8 460 aa3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms