RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
LTB-211ENST00000446745 RNF31Q96EP0 1072 aa20.4■□□□□ 0.86
LTB-211ENST00000446745 TCF12Q99081 682 aa20.4■□□□□ 0.86
LTB-211ENST00000446745 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.4■□□□□ 0.86
LTB-211ENST00000446745 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa20.4■□□□□ 0.86
LTB-211ENST00000446745 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
LTB-211ENST00000446745 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.4■□□□□ 0.86
LTB-211ENST00000446745 MAGEB16A2A368 324 aa20.39■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 VAPBO95292 243 aa20.39■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 RECKO95980 971 aa20.39■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 ST6GAL1P15907 406 aa20.39■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 CYP2A7P20853 494 aa20.39■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 KCNAB2Q13303 367 aa20.39■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 KCNJ11Q14654 390 aa20.39■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.39■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.39■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 CT55Q8WUE5 264 aa20.39■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 TCTN2Q96GX1 697 aa20.39■□□□□ 0.85
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LTB-211ENST00000446745 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.39■□□□□ 0.85
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LTB-211ENST00000446745 TMEM150CB9EJG8 249 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 H3BMM5 538 aa20.38■□□□□ 0.85
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LTB-211ENST00000446745 GPC4O75487 556 aa20.38■□□□□ 0.85
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LTB-211ENST00000446745 HBQ1P09105 142 aa20.38■□□□□ 0.85
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LTB-211ENST00000446745 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 KIR2DS3Q14952 304 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 CYP1B1Q16678 543 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 DEFB109BQ30KR1 87 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 TTC27Q6P3X3 843 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 GPR135Q8IZ08 494 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 SLC35F6Q8N357 371 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 RAB42Q8N4Z0 105 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 MR1Q95460 341 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 CLIP3Q96DZ5 547 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 MFSD3Q96ES6 412 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 LRFN5Q96NI6 719 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 SLC25A18Q9H1K4 315 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 STARD5Q9NSY2 213 aa20.38■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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LTB-211ENST00000446745 TERTO14746 1132 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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LTB-211ENST00000446745 UGT2B7P16662 529 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 F8A1P23610 371 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 FNTAP49354 379 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 RAB28P51157 221 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 ITGA1P56199 1179 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 KRT222Q8N1A0 295 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 MCUQ8NE86 351 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 FOPNLQ96NB1 174 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 TWSG1Q9GZX9 223 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 P2RY12Q9H244 342 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 POLHQ9Y253 713 aa20.37■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 A0A0J9YY10 115 aa20.36■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.36■□□□□ 0.85
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LTB-211ENST00000446745 ISM1B1AKI9 464 aa20.36■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 E7EQ34 232 aa20.36■□□□□ 0.85
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LTB-211ENST00000446745 ERV3-1Q14264 604 aa20.36■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 SLC5A12Q1EHB4 618 aa20.36■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa20.36■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa20.36■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 OR2A14Q96R47 310 aa20.36■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa20.36■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 ACTL8Q9H568 366 aa20.36■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.36■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 SNX12Q9UMY4 172 aa20.36■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 CDYLQ9Y232 598 aa20.36■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.35■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 CDC14CA4D256 554 aa20.35■□□□□ 0.85
LTB-211ENST00000446745 J3QKU1 62 aa20.35■□□□□ 0.85
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