RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
PTPA-222	ENST00000445241	PCM1	Q15154	2024 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	OR6C74	A6NCV1	312 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	FAM159B	A6NKW6	160 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	C2orf74	A8MZ97	194 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	FKBP9	O95302	570 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	RGS4	P49798	205 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	RAB28	P51157	221 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	GFER	P55789	205 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	IRGC	Q6NXR0	463 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC25	Q86WR0	208 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	IFT20	Q8IY31	132 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	FGF11	Q92914	225 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	TGM7	Q96PF1	710 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	TAAR9	Q96RI9	348 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	FMO2	Q99518	471 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	GPR21	Q99679	349 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	CPNE1	Q99829	537 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	ICK	Q9UPZ9	632 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	VWA7	Q9Y334	891 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	ADAMTS20	P59510	1910 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	RASSF9	O75901	435 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	TNFSF15	O95150	251 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf105	O95561	183 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	FDXR	P22570	491 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	PKLR	P30613	574 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	SSTR1	P30872	391 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	HSD17B2	P37059	387 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	GPX6	P59796	221 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	MC2R	Q01718	297 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	ABR	Q12979	859 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	PRKG2	Q13237	762 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	KIR2DS3	Q14952	304 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	BMPER	Q8N8U9	685 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	MDM1	Q8TC05	714 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD7	Q92527	254 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	GALP	Q9UBC7	116 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		14.19	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	PIPSL	A2A3N6	862 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF839	A8K0R7	811 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	GFY	I3L273	518 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	BTN3A1	O00481	513 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	RASGRF2	O14827	1237 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	MSL3P1	P0C860	447 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	MPST	P25325	297 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	PHB	P35232	272 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	SP140	Q13342	867 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	IL11RA	Q14626	422 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	SLMAP	Q14BN4	828 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	ANKS6	Q68DC2	871 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPA-222	ENST00000445241	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		14.18	□□□□□ -0.14

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