RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436228.6

SPDYE2B-201, Transcript of speedy/RINGO cell cycle regulator family member E2B, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPDYE2B, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2B-201ENST00000436228 CAPZBP47756 277 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 LSSP48449 732 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 LIMK2P53671 638 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 USP10Q14694 798 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 FAM153CQ494X1 144 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 IRGCQ6NXR0 463 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 PAQR3Q6TCH7 311 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 TAOK1Q7L7X3 1001 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 AMIGO1Q86WK6 493 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 OR52E1Q8NGJ3 308 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 GIMAP7Q8NHV1 300 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 SLC30A3Q99726 388 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 HRASLS2Q9NWW9 162 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 RAXQ9Y2V3 346 aa16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 V9GYY5 206 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 ACACAQ13085 2346 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 MATN2O00339 956 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 CASC3O15234 703 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 BRINP1O60477 761 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 INHBAP08476 426 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 ABHD2P08910 425 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 CSF2RBP32927 897 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 GABREP78334 506 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 RSC1A1Q92681 617 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 FGF11Q92914 225 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 LINGO1Q96FE5 620 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 GPR22Q99680 433 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 OLFM1Q99784 485 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCDC77Q9BR77 488 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 FUT8Q9BYC5 575 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 KLHL3Q9UH77 587 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 NFS1Q9Y697 457 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 IGF2RP11717 2491 aa16.19■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 BPTFQ12830 3046 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCDC187A0A096LP49 1063 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 GSAPA4D1B5 854 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 OR5K3A6NET4 321 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZBTB14O43829 449 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 RASSF9O75901 435 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 DXOO77932 396 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 MATN4O95460 622 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 C1orf105O95561 183 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 C1QAP02745 245 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 STMN1P16949 149 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCKBRP32239 447 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 MSH2P43246 934 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 BDKRB1P46663 353 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 TAS2R39P59534 338 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 ERVPABLB-1P60509 514 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 TBC1D25Q3MII6 688 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 IGF2-ASQ6U949 168 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCDC74BQ96LY2 380 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 TGM7Q96PF1 710 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 RAB33BQ9H082 229 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 SEMA6CQ9H3T2 930 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 XKR8Q9H6D3 395 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 POPDC3Q9HBV1 291 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 THSD1Q9NS62 852 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 OGFRQ9NZT2 677 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 EPHA6Q9UF33 1036 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa16.18■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 URB1O60287 2271 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 A0A087WV48 116 aa16.17■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa16.17■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa16.17■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 RIPK2O43353 540 aa16.17■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 FAM155BO75949 473 aa16.17■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 MPOP05164 745 aa16.17■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 C8GP07360 202 aa16.17■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 TUBBP07437 444 aa16.17■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 ITGA2BP08514 1039 aa16.17■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 MYBL2P10244 700 aa16.17■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SPDYE2B-201ENST00000436228 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms